Från kalfjället vid gränstrakterna mellan Sverige, Finland och Norge forsar Muonioälven fram till mynningen nära Pajala. Muonioälven är undantagen från vattenkraftsutbyggnad; vattnet är rent och klart. Avrinningsområdet är 14 430 km² och medelvattenföringen 165 m³/s. Övre delen från gränssjön Kilpisjärvi kallas Könkämäälven.