Vid faderns död ärvde Maria alla burgundiska besittningar, varav flera dock lösgjorde sig eller knöts till Frankrike. Hennes undersåtar sökte avkräva henne stora privilegier. Marias äktenskap med den blivande tysk–romerske kejsaren Maximilian I 1477 ledde till att hennes arvländer, främst stora områden i Nederländerna, tillföll huset Habsburg.