Boesak var en ledande motståndare till apartheidregimen. Han har även varit ordförande i Reformerta Världsalliansen och har verkat inom Kyrkornas Världsråd. Han förenar en evangelikal hållning med en samhällsinriktad förkunnelse och är en av de främsta företrädarna för sydafrikansk befrielseteologi med starka inslag av svart teologi, bl.a. genom sin doktorsavhandling Farewell