F. byggde 1910 sitt första flygplan ”Spin” och grundade 1912 i Tyskland den flygplansfabrik som senare utvecklades till företaget Fokker, vars ledare han blev. Utöver sina flygplanskonstruktioner blev F. känd för utvecklingen av den synkroniserade kulsprutan, vilken medgav skjutning genom ett jaktflygplans propellerfält.