Tidskriften grundades av F. Hoppe-Seyler 1877 under namnet Zeitschrift für Physiologische Chemie. Efter Hoppe-Seylers död 1895 benämndes tidskriften Hoppe-Seylers Zeitschrift für physiologiche Chemie. År 1984 ändrades namnet till Biological Chemistry Hoppe-Seyler, vilket senare förkortats till nuvarande namn.