L. blev av Johan III utsedd till riksråd 1589 men höll sig i bakgrunden under de politiska striderna. Han medverkade dock vid den av hertig Karl utlysta riksdagen i Arboga 1597 men ådrog sig dennes missnöje under den fortsatta maktkampen och fängslades. Under den rättegång som slutade med Linköpings blodbad