Bakom Estoniasamlingen stod Styrelsen för psykologiskt försvar, som 2001 fick regeringens uppdrag att skapa en faktabank om förlisningen. Sedan 2009 handhas samlingen av Myndigheten för samhällsskydd och beredskap. Estoniasamlingen innehåller handlingar och dokument från bl.a. Statens haverikommission, Sjöfartsverket, polisen, åklagarmyndigheten i Stockholm, Statens kulturråd samt anhörig- och överlevandeorganisationer. Till detta