Funke blev 1944 sekreterare i den naturvetenskapliga forskningskommissionen och 1945 sekreterare i atomkommittén. När Statens naturvetenskapliga forskningsråd bildades 1946 utsågs Funke till sekreterare. Atomkommittén ombildades 1959 till Statens råd för atomforskning, nu med Funke som både sekreterare och ledamot.