Unionen bildades 1984 av fem församlingar, dels utbrytargrupper ur Förenade Islamiska Församlingar i Sverige, dels fristående föreningar. Först hette man Islamiska Centerunionen, ICU. Snart lades ”i Sverige” till, och unionen kom att förkortas ICUS. År 1993 tog Islamiska Kulturcenterunionen sitt nuvarande namn. Den organiserar endast sunnitiska föreningar.