Som kyrkoledare bekämpade Kyrillos av Alexandria heretikerna och drev ut judarna ur staden. I överensstämmelse med alexandrinsk teologi hävdade han enheten mellan gudomligt och mänskligt i Kristus och blev i slutet av 420-talet patriarken Nestorios främste teologiske motståndare. Kyrillos av Alexandria räknas som kyrkolärare i romersk-katolska kyrkan och firas 27 juni.