Muonio ligger vid riksgränsen mot Sverige. I Muonio finns ett stort antal sjöar och kommunens högsta punkter når cirka 600 meter över havet. En stor del av Pallas-Ounastunturi nationalpark finns i Muonio. Av arbetsplatserna finns de flesta inom servicesektorn. Turismen och renskötseln är viktiga näringsgrenar. Kyrkbyn är en viktig transportknutpunkt