E. kan sägas vara en av cellfysiologins grundläggare, men han gjorde också värdefulla organfysiologiska arbeten. Han studerade flimmerrörelser hos mikroorganismer, retningsfortledning i muskler, mekanismen för musklernas sammandragning, ögats ljusadaption och växternas fotosyntes. För det senare använde han bakterier för att jämföra syrgasmängder bildade i olika slags ljus.