Bode nyordnade och utvidgade konstsamlingarna vid de statliga museerna i Berlin (vilkas generaldirektör han var 1900–20) genom att ordna bl.a. bildkonst och möbler från samma epok till en enhetlig museiinteriör. Sin forskning ägnade Bode främst italiensk renässanskonst och nederländskt 1600-talsmåleri.