Duisbergs forskning ledde till att flera nya syntetiska färgämnen kunde framställas. Från 1912 var han generaldirektör för Farbenfabriken Bayer AG Leverkusen. Han arbetade länge för en sammanslagning av den tyska kemiska industrin, något som 1925 resulterade i bildandet av IG Farbenindustrie AG, vars styrelseordförande han blev.