Dmitrij Muratov har varit aktiv som journalist sedan mitten av 1980-talet och arbetade för nyhetstidningen Komsomolskaja Pravda, officiellt organ för Komsomol, den kommunistiska ungdomsorganisationen i Sovjetunionen. Han lämnade Komsomolskaja Pravda 1988 och grundade tillsammans med tidigare kollegor därifrån Novaja Gazeta (’Nya tidningen’) 1993. Han har under merparten av Novaja Gazetas existens haft rollen