Reimarus var präglad av upplysningstidens rationalism. Han vann inflytande efter sin död, då Lessing på 1770-talet publicerade utdrag, de s.k. Wolfenbüttelfragmenten, ur hans efterlämnade huvudverk, Apologie oder Schutzschrift für die vernünftigen Verehrer Gottes (’Apologi eller försvar för de rationella Gudsdyrkarna’). Särskilt ett av dessa utdrag, ”Von dem Zwecke Jesu