Det är endast färgen som skiljer raserna åt. En paint horse är skäck, vilket en quarterhäst inte får vara. I rasen förekommer två genetiskt skilda skäckfärger, tobiano (dorsalskäck) och overo (ventralskäck). Om hästen har anlag för båda kallas färgen tovero. När aveln av quarterhästar organiserades på 1940-talet godtogs