Som ledare för stadens civila och militära byggnadväsende uppförde han bl.a. Fortezza di Belvedere (1590–95) och stora delar av Uffizierna (1563–80), bl.a. den renässanstypiska teater- och festlokalen Teatro Mediceo. Hans innovativa fantasteri illustreras såväl av grottorna i Boboliträdgårdarna (1583–88) som av teckningar till spektakulära scenuppsättningar.