Gränsen mot Östersjön sätts nära trösklarna, i Öresund där tröskeldjupet är 8 m vid Drogden och i Mecklenburgerbukten, där motsvarande djup är 18 m vid Gedser rev. Väster om denna bukt ligger Kielbukten, som i norr har gräns mot dels Lilla Bält, dels Stora Bält. Dessa båda sund förenar sig i Samsø