I samband med en större omstrukturering av försvaret 1994 upphörde CA som självständig myndighet. Inom det då bildade Högkvarteret inrättades befattningen chefen för arméledningen. 1998 omorganiserades Högkvarteret än en gång. Ansvaret för utvecklingen av arméstridskrafterna övertogs av generalinspektören för armén, GIA, som ledde verksamheten från Armétaktiska kommandot (ATK)