Hübner är utbildad ekonom och sedan 1992 professor vid Warsaw School of Economics. Hon har tidigare varit bland annat handelsminister (1997–98) och Europaminister (2003–04). Hon hade en ledande roll i förhandlingarna om polskt medlemskap i OECD (1996) och i EU (2004). Hübner ansvarade inom Europeiska kommissionen för regionalpolitiska frågor.