Fitzroy Rivers tillflöden är Hann- och Margaretfloderna samt Christmas Creak. Floden mynnar i Indiska oceanen vid King Sound. Vattenflödet är högt under sommaren, men under juli–december är de övre delarna mestadels torra. Det förekommer att en tidvattenvåg på en meter tränger långt in i nedre delen. Vatten avleds för risodling