Fortifikationskåren bildades 1937, då den tidigare Fortifikationen uppdelades i Fortifikationskåren, ingenjörtrupperna och signaltrupperna. Fortifikationskårens förste chef var samtidigt chef för Arméförvaltningens fortifikationsstyrelse och inspektör över rikets befästningar (IRB). 1961 inrättades vid försvarsstaben en ny avdelning, befästningsinspektionen, vars chef tillika blev chef för Fortifikationskåren samt IRB. I egenskap av personalkårchef lydde chefen för Fortifikationskåren