Gunnar Ågren har som läkare (specialitet socialmedicin) varit verksam i Stockholm inom psykiatri samt som socialläkare. Åren 1982–99 var Ågren forskningsledare vid Stockholms stads socialförvaltning och var då inriktad på missbruk och hemlöshet. Han var 1973–99 ledamot av Stockholms läns landsting samt gruppledare där för vänsterpartiet, 1994–98 även landstingsråd med