Flodmynningar, skärgårdar och vikar kan vara lämpliga lägen för naturliga hamnar, och många hamnar är byggda med särskilda skydd mot vågor, vågbrytare, samt kajer, pirar och annan kringutrustning som t.ex. byggnader för lagring, passagerarterminaler, reparationsverkstäder och behandlingscentraler för avfall och farligt gods.