Efter läroår hos Martin Schongauer och i Italien blev Burgkmair 1498 mästare i Augsburg. Hans målningar visar stark påverkan från italienskt renässansmåleri. Hans huvudverk är två altartavlor, båda nu i München, Johannesaltaret (1518) och Korsfästelsealtaret (1519). Som tecknare framträder han i kejsar Maximilian I:s prakthandskrifter.