Khartoum är beläget mellan Blå och Vita Nilen där dessa bildar Nilen. Staden bildar tillsammans med grannstäderna al-Khartum Bahri (Norra Khartoum) på Nilens östra sida och Omdurman (Umm Durman) på Nilens västra sida, en konurbation med 4,2 miljoner invånare (2012). Khartoum har internationell flygplats och är Sudans kulturella, politiska