Louise Karlsson hade framgångar i främst kort bassäng (25 m). I VM vann hon guld 1997 och brons 1995 på 200 m medley samt brons på 4×100 m fritt 1995 och 1997. I EM tog Karlsson guld på 50 m bröst 1992, 50 m fjäril 1992 och 1993, 100 m medley 1991, 1992, 1993 och 1994,