Det gäller bl.a. mål som har prövats enligt miljöbalken och som gäller verksamheter och åtgärder som kan påverka miljön eller människors hälsa på olika sätt. Domstolen är en avdelning inom Svea hovrätt. Domar och beslut från Mark- och miljööverdomstolen kan överklagas till Högsta domstolen.