Inom cytologin avses med cytoplasmamatrix den strukturlösa vätskefasen mellan cellorganeller och cytoplasmafilament samt med mitokondriematrix innehållet i mitokondrierna mellan de veckbildningar, cristae, som från membranen buktar in i mitokondriens inre. Matrix kallar man också grundsubstansen i växters cellväggar, dvs. den del av cellväggen som inte är cellulosamikrofibriller.