Mayaspråken räknas ofta till den större penutiska språkfamiljen (se penutiska språk), men denna klassifikation är omtvistad. Bland mayaspråken urskiljs ett antal grupper (viktigaste företrädare anges inom parentes): chol–tzeltalspråk (chol, tzeltal, tzotzil), huastekiska (huastec), kanjobal–chujspråk (kanjobal, chuj), quiché–mamspråk (kaqchikel, quiché, kekchí). Dessutom tillkommer det största mayaspråket, yukatekiska (också kallat ”yukatekisk ”maya”