Specialpedagogiska skolmyndigheten övertog vid bildandet all verksamhet från Specialpedagogiska institutet, Specialskolemyndigheten och Socialstyrelsens institut för särskilt utbildningsstöd (SISUS). Specialpedagogiska skolmyndigheten förmedlar information och kunskap om specialpedagogiska frågor och läromedel till ansvariga inom offentligt skolväsende till förmån för elever med t.ex. syn- eller hörselskada, dövblindhet, grava tal- och språkstörningar och utvecklingsstörning.