Under kolonialkyrkan utrotades urfolkens religioner. Efter självständigheten 1821 förlorade katolska kyrkan sina privilegier. Metodister, lutheraner och baptister kom på 1800-talet, liksom herrnhutismen som kom till atlantkusten, där afro och urfolken har sina religiösa traditioner. Cirka 90 procent av befolkningen är katoliker. Ett ekumeniskt samarbete riktas mot fattigdom. Evangelikala grupper växer mest.