Festus Mogae utbildade sig till ekonom i bland annat Oxford och arbetade under 1970-talet för Internationella valutafonden (IMF). År 1980 utsågs han till chef för Botswanas centralbank och 1982 blev han president Ketumile Masires ständige sekreterare. Åren 1989–98 var han finansminister samt minister för utveckling, 1992–98 även vicepresident.