År 1774 avsattes Thunborg från sin komministertjänst i Sveg och från sitt prästämbete på grund av sitt starka engagemang i en extatisk pietistisk väckelse kring bondhustrun Karin Olofsdotter, ”Bång-Karin”. Han dömdes till internering i Härnösands hospital men avled innan domen hann verkställas.