Samordningen av de båda systemen sker främst i hypotalamus, där inkommande nervtrådar från stora delar av centrala nervsystemet reglerar aktiviteten i olika nervcellsgrupper, s.k. kärnor. I dessa nervcellsförbindelser förekommer som signalsubstanser såväl dopamin, noradrenalin, serotonin och acetylkolin som aminosyror och peptider. Vissa av dessa nervcellsgrupper frisätter peptidhormoner, releasing hormones, som