Då denna gemenskap tio år senare bröt samman till följd av bland annat inbördeskriget i Uganda, kvarstod banken som gemensam institution. Nytt samarbetsavtal 1980 samt viss rekonstruktion och sanering har möjliggjort ytterligare stöd från bland annat Tyskland, Nederländerna och från Afrikanska utvecklingsbanken, som också är delägare.