Friis ägnade merparten av sina forskningar åt dansk utrikespolitik, särskilt 1700-talets diplomati och den dansk-tyska frågan efter 1864. Han utgav ett stort antal källpublikationer, och bland hans viktigare arbeten märks Bernstorfferne og Danmark (1–2, 1903–19) och Den Danske Regering og Nordslesvigs Genforening med Danmark (1–3, 1921–48).