Med formskicklighet och elegans tillämpade Agi Lindegren det sena 1800-talets historiserande stiltänkande i bland annat Biologiska museet i Stockholm (1893), ”Cassels donation” i Grängesberg (1900) och Gustav Vasa kyrka i Stockholm (1906). Han utförde flera väggdekorationer inspirerade av bland andra William Morris växtornamentik, framför allt vid sina kyrkorestaureringar.