Sedan 1954 har Berliner Ensemble ett eget teaterhus, Theater am Schiffbauerdamm. Fram till 1971 var truppens ledare Brechts hustru, skådespelerskan Helene Weigel. Bland senare teaterchefer märks Ruth Berghaus (1971–77), Manfred Wekwerth (1977–89) och Claus Peymann (sedan 1999). Från 1992 leddes teatern några år av ett femmannaråd.