Cellyteantigener kan bestå av kolhydrater, fetter eller proteiner. Cellyteantigenerna hos mikroorganismer är viktiga mål för immunförsvaret vid infektioner, och antigen av denna typ ingår därför normalt i vacciner. Inom den egna arten kan genetisk variation skapa cellyteantigener av typen ABO-blodgruppsantigener och HLA-transplantationsantigener. Reaktioner mot cellyteantigener inom arten kan skapa problem