Colón grundades 1850 under namnet Aspinwall som ändpunkt på Panamas första järnväg och är en av de viktigaste hamnarna i Karibiska havet. I samband med anläggandet av Panamakanalen, enligt ett avtal från 1903, uppförde USA betydande hamnanläggningar och varv i Cristóbal (numera en förort till Colón).