Fjärde sjöstridsflottiljen har sin bas i Berga söder om Stockholm och i Skredsvik vid Gullmarsfjorden, där röjdykardivisionen är lokaliserad. Fjärde sjöstridsflottiljen övervakar svenskt sjöterritorium och övar på sin krigsuppgift (att försvara Sveriges territorium och svenska intressen) samt hämtar in underrättelser, röjer minor och skyddar havsområden, sjövägar och sjöfart.