Efter utbildning till kyrkomusiker i Malmö och Paris grundade Fredrik Malmberg 2003 i Stockholm elitensemblen (Svenska) Vokalharmonin, specialiserad på tidig och nutida musik. Sedan 2012 är han professor i kördirigering vid Kungliga Musikhögskolan och chefsdirigent för Eric Ericsons Kammarkör i Stockholm, där han även tjänstgör som kyrkomusiker i Oscars församling.