Morgagni publicerade 1761 boken De sedibus et causis morborum per anatomen indagatis libri quinque (’Fem böcker om sjukdomarnas säte och orsaker uppspårade av anatomen’). Den består av sjuttio brev till läkarkolleger, där Morgagni slår fast att sjukdomar har sitt säte i organ och inte som i den gamla humoralpatologin