Närbelägenheten medför att genetisk rekombination sällan sker; haplotypen ärvs alltså i regel som en enhet. Vissa haplotyper är funktionellt sammanhörande, dvs. påverkar gemensamt en viss egenskap; ett exempel är generna för HLA-systemet. Som en fortsättning på kartläggningen av människans genom (se HUGO) startades 2002 en internationell vetenskaplig samverkan för en