För motstånd mot inkvarteringen av knektar (borgläger) inspärrades Ilkka 1595 på Åbo slott men lyckades fly. Sedan ett bondeuppror, det s.k. klubbekriget, utbrutit i södra Österbotten 1596 blev Ilkka ledare för en bondehär, som tågade söderut. Efter härens nederlag lät Clas (Eriksson) Fleming avrätta Ilkka vid Ilmola kyrka i januari