Johannes Gezelius studerade bl.a. i Oxford och Frankfurt, där han påverkades av Spener. Han blev professor i orientaliska språk i Åbo 1675, superintendent i Ingermanland 1681 och i Narva 1684. Från 1690 var han biskop i Åbo efter sin far men måste 1713 lämna sitt av ryssarna erövrade stift.