Lenín Moreno har studerat offentlig administration och psykologi på universitetet i Quito och jobbade under flera år i den offentliga administrationen, bland annat inom turistnäringen. 1998 sköts han i ryggen under ett rån och blev förlamad i benen. Han har sedan dess använt rullstol och utnämndes 2013 till FN:s speciella