Louis Botha föddes i Natal, var ursprungligen lantbrukare men blev senare ämbetsman i boerrepubliken Transvaal. På 1890-talet, då Storbritannien försökte pressa boerrepublikerna att acceptera ”uitlanders” (framför allt engelsmän) som lagliga medborgare, följde Botha en moderat linje. Under boerkriget 1899–1902 gav han dock boerna sitt fulla stöd, och 1900 blev han